明治时代，随着文明开化及迅速西化，使得日本进入前所未有的改革期。无法接受这种变化的人、及对于新政府有所不满的人因此犯下罪过。而囚禁这些罪犯的地方，便是位于日本最大湖——琵琶湖湖心的巨树监狱！以作为摆渡人，代代供奉大蛇的阴天神社三兄弟为中心，各式各样的现实与未解之谜交错，潇洒奢华的故事终于揭开序幕。

某天，一辆运钞车遭到抢劫团伙袭击，高达2.6亿日元的现金被对方劫持。罪犯在逃跑过程中慌不择路，闯进了一座大型购物中心，并以此为据点劫持了多达50名的人质。警视厅搜查一课特殊搜查班（SIT）的宇佐木玲子（米仓凉子 饰）进入现场与罪犯谈判，谁知就在关键时刻SAT突入现场，引发了中心的爆炸。御堂启一郎（津川雅彦 饰）以主犯身份投降，而其他犯人则趁乱逃跑。数周后，玲子在羽田机场重逢当时作为人质的木元佑介（林遣都 饰），盘桓心底的疑问让她感觉到了些许异样。不久后劫机事件发生，劫持者要求释放御堂，否则一小时后将屠杀人质。 危机时刻，玲子成为左右事件成败的关键……

情报科窃听小组三兄弟情同手足，梁俊义（刘青云 饰）正直而又懦弱，在个人感情问题上托泥带水；杨真（古天乐 饰）家境窘困，不仅要应付身患白血病儿子的随时可能出现的突发情况，而且自己也病入膏肓，命不久矣；林...

企业家龙鸣乡在寻访汝瓷烧制工艺的过程中被买通的人手困在深山而音信全无，情急之下龙鸣乡妻子不得不求助旧友聂宏斌，却不想早已侨居海外的聂宏斌毅然回国却深陷利益泥潭，随着调查的逐渐深入，不仅发现昔日的至交好友或成为幕后的黑手，连自己的生命也受到威胁。曾经为了义气能“共苦”的患难兄弟，如今反目成仇痛下杀招而不能“同甘”，龙鸣乡是否丧身深山，聂宏斌会否被金钱腐蚀，阴谋背后究竟是什么利益牵扯？最毒兄弟的纠葛将观众也带入利益与义气的漩涡，迷局已然设下……